Ограничение на выгрузку данных api creatio

Андрей, специально никаких ограничений не предусмотрено. Возможно, если отправляете много тяжёлых запросов одновременно, происходит снижение скорости выборки из БД, если на всё не хватает ресурсов сервера. Может, и в интеграции что-то делается не так, например, для каждого запроса создаётся новая сессия.

Либо Вы столкнулись с ограничением в 20000 записей, которое устанавливается в web.config, если не ошибаюсь, параметр maxEntityRowCount.

А как у Вас это проявляется?