После установки пакета создается резервная копия конфигурации, где она хранится?

Андрей, эта логика реализована в веб-сервисе /0/ServiceModel/PackageInstallerService.svc/CreateBackup, он реализован на уровне ядра. Насколько понял, сохранение происходит в системную папку для временных файлов на веб-сервере, создаются файлы с именами DeleteList.txt, AppInfo.txt, AppDependentPackagesUIdsInfo.txt.

Информация, в том числе и  лог о результатах загрузки пакета, пишется в подпапки внутри папки PackageInstallation, у меня она была в C:\Windows\Temp\3\IIS APPPOOL_MySiteName\Default.