При выборе справочного поля в простых фильтрах открывается полный список объектов этого справочника. Возможно ли каким-то образом повлиять на эту выборку и применить фильтрацию к отображаемым значениям?

Речь идет не о списке полей, а именно о значениях этих полей.

Есть необходимость подобной фильтрации в кастом-фильтрах хотя бы в реестрах (Section)