Навскидку: 

1. В объекте добавить Boolean поле - отметка на удаление

2. На событие в объекте Before deleting record проверять установленный факт подтверждения. Если его нет, то ставить отметку на удаление, а самое удаление отменять

3. Каким-то образом (скорее всего, отдельный раздел "Подтверждения удаления") формировать запись для визирования руководителю

4. После установки визирования снова удалять запись. Тут уже факт подтверждения есть, потому запись можно удалить в событии Before deleting record

Если добавлять обработчик в базовом объекте, то очень осторожно, чтобы не сломать какую-то стандартную логику проверкой на какой-нибудь системной таблице.

Можно и более высокоуровнево, скрыть в разделах и деталях (можно через базовую страницу) кнопку удаления и вместо неё добавить кнопку запуска БП, который будет до реального удаления скрывать запись от нажавшего (если администрируется по записям), задавать вопрос кому нужно, а затем действительно удалять.